Die stadtgeschichtliche Sammlung wurde 1983 im Alten Rathaus eröffnet und zeigt Urkunden, Münzen, Bodenfunde, Text- und Bilddokumente in thematischen Zusammenhängen: Frühgeschichte im Raum Neuenburg am Rhein, Stadtgeschichte von der Gründung 1175 durch Berthold IV. von Zähringen, über die Erhebung zur Reichsstadt 1219/1274 bis hin zur Zeit Kaiser Josephs II., die Bedeutung des Rheins für die Stadt (Rheinregulierung und deren Folgen), die Stadt vor und nach dem Zweiten Weltkrieg.