Das Museumsgebäude im Zentrum der Altstadt wurde 1726 als Getreidespeicher errichtet und diente von 1851 bis 1991 als Rathaus. Die sieben Museumsräume mit zusammen 300 Quadratmetern Ausstellungsfläche befinden sich im ersten und zweiten Obergeschoss. Träger des 1993 eröffneten Museums ist die Stadt. Betreut wird es vom Heimatverein, der die reichen Museumsbestände aus Spenden und Leihgaben Merkendorfer Bürger zusammengetragen hat. Das Museum bietet einen interessanten Einblick in das frühere Leben, Wohnen und Arbeiten in einer kleinen Ackerbürgerstadt.