Das Museum wurde als Abteilung des Instituts für neutestamentliche Textforschung von Prof. D. Kurt Aland begründet und am 8. März 1979 im Beisein von Bundespräsident Walter Scheel mit einem Festakt eröffnet. 1983 übernahm Frau Prof. Lic. Dr. Barbara Aland die Leitung, die im Oktober 2004 an Prof. Dr. Holger Strutwolf überging.
Grundlage des Bestandes ist eine private Sammlung. Dazu kamen die zum Teil in das Museum integrierten Altbestände des Instituts für neutestamentliche Textforschung. Im Laufe der Jahre konnte die Sammlung durch bedeutsame Exponate ergänzt werden, außerdem wird sie regelmäßig durch wechselnde Leihgaben eines privaten Handschriftensammlers aus Norwegen bereichert.
1986 wurde das Museum um drei Räume erweitert. Gezeigt werden ca. 350 Ausstellungsstücke, der Rest der Bestände wird zum Teil in Sonderausstellungen des Museums der Öffentlichkeit zugänglich gemacht.
Im Laufe der Jahre hat das Museum immer wieder auswärtige Ausstellungen veranstaltet, z.B. in Brüssel, Düsseldorf und zum Kirchentag in Gelsenkirchen. Außerdem stellt das Museum regelmäßig Bibelausstellungen anderer Veranstalter Stücke aus seinem umfangreichen Archiv zur Verfügung.
